Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms