Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TSPOP30536 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TSPOP30536 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TSPOP30536 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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