Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms