Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms