Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PLNP26678 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PLNP26678 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms