Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms