Protein–RNA interactions for Protein: P20674

COX5A, Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5AP20674 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX5AP20674 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX5AP20674 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX5AP20674 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms