Protein–RNA interactions for Protein: P20382

PMCH, Pro-MCH, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHP20382 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHP20382 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHP20382 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHP20382 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHP20382 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHP20382 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHP20382 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms