Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TCP1P17987 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TCP1P17987 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TCP1P17987 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TCP1P17987 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TCP1P17987 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TCP1P17987 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TCP1P17987 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms