Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRF1P14222 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRF1P14222 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRF1P14222 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRF1P14222 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRF1P14222 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRF1P14222 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRF1P14222 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRF1P14222 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRF1P14222 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRF1P14222 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms