Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms