Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYH1P12882 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYH1P12882 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYH1P12882 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYH1P12882 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYH1P12882 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYH1P12882 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYH1P12882 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYH1P12882 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYH1P12882 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYH1P12882 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYH1P12882 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MYH1P12882 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MYH1P12882 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYH1P12882 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MYH1P12882 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYH1P12882 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYH1P12882 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYH1P12882 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYH1P12882 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYH1P12882 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYH1P12882 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYH1P12882 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYH1P12882 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYH1P12882 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYH1P12882 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYH1P12882 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms