Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms