Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms