Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms