Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NGFRP08138 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NGFRP08138 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NGFRP08138 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NGFRP08138 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NGFRP08138 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms