Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC1P02654 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC1P02654 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC1P02654 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms