Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHDP01880 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHDP01880 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHDP01880 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHDP01880 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHDP01880 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHDP01880 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHDP01880 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHDP01880 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHDP01880 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHDP01880 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHDP01880 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHDP01880 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHDP01880 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHDP01880 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHDP01880 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHDP01880 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms