Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYF2O95926 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYF2O95926 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYF2O95926 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYF2O95926 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms