Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms