Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMDSO60547 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMDSO60547 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms