Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms