Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNQ3O43525 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms