Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDM6AO15550 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms