Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BCKDKO14874 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms