Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD8O14715 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD8O14715 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms