Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms