Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms