Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms