Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DXG7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DXG7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DXG7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms