Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms