Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms