Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF839A8K0R7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF839A8K0R7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms