Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf49A4QMS7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms