Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms