Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AUP1Q9Y679 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AUP1Q9Y679 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AUP1Q9Y679 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms