Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPO11Q9Y5K1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPO11Q9Y5K1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPO11Q9Y5K1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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