Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL3Q9Y4R7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL3Q9Y4R7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL3Q9Y4R7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms