Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M1Q9Y2T2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3M1Q9Y2T2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3M1Q9Y2T2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms