Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPH3AQ9Y2J0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPH3AQ9Y2J0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPH3AQ9Y2J0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPH3AQ9Y2J0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms