Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A6Q9Y289 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A6Q9Y289 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A6Q9Y289 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A6Q9Y289 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms