Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPK3Q9UPE1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPK3Q9UPE1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms