Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHA4Q9UN74 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHA4Q9UN74 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHA4Q9UN74 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHA4Q9UN74 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHA4Q9UN74 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHA4Q9UN74 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHA4Q9UN74 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCDHA4Q9UN74 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHA4Q9UN74 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHA4Q9UN74 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHA4Q9UN74 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHA4Q9UN74 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms