Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNRGQ9UMZ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNRGQ9UMZ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNRGQ9UMZ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNRGQ9UMZ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNRGQ9UMZ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNRGQ9UMZ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNRGQ9UMZ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNRGQ9UMZ2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNRGQ9UMZ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNRGQ9UMZ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNRGQ9UMZ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYNRGQ9UMZ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNRGQ9UMZ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNRGQ9UMZ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNRGQ9UMZ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms