Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNOT6Q9ULM6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6Q9ULM6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6Q9ULM6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms