Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC24A2Q9UI40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SLC24A2Q9UI40 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms