Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK1NQ9UHG2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCSK1NQ9UHG2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms