Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA9Q9UGM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA9Q9UGM1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.6 ms