Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGGBP1Q9UFW8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGGBP1Q9UFW8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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