Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP9

GULP1, PTB domain-containing engulfment adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GULP1Q9UBP9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GULP1Q9UBP9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GULP1Q9UBP9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GULP1Q9UBP9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GULP1Q9UBP9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms